História školy sa začala písať v roku 1953, vtedy sa nazývala Osemročná stredná škola.
Neskôr bola pomenovaná ako Základná deväťročná škola a neskôr ako Základná škola.
Od 1. júna 1989 získala hrdý názov Základná škola Ľudovíta Štúra Modra - za vynikajúce výsledky.
V roku 1998 sa škola presťahovala z budovy kláštora na Štúrovej ulici a z elokovaných tried na Národnej a Dolnej ulici do novovybudovaných priestorov na Komenského ulici.
Od 1. 7. 2002 sme školou s právnou subjektivitou. V právnych vzťahoch vystupuje škola vo vlastnom mene a má zodpovednosť vyplývajúcu z týchto vzťahov.
3.9.2005 sme otvorili novú telocvičňu - športovú halu.